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在這篇博文中，我們將展示如何利用北鯤云HPC平臺(tái)在AWS運(yùn)行運(yùn)行基因分析HPC任務(wù)。 概述 本指南將向您展示如何通過北鯤云控制臺(tái)啟動(dòng)基于Amazon EC2構(gòu)建的slurm集群，該集群提供有一個(gè)登錄節(jié)點(diǎn)，您可以在此節(jié)點(diǎn)上通過簡單配置結(jié)合AWS S3存儲(chǔ)快速投遞多個(gè)基因分析任務(wù)。

圖3 智能代理優(yōu)化模塊2.0升級(jí) 3）HPC集群調(diào)度引擎適配 部分企業(yè)會(huì)部署并使用高性能計(jì)算集群（HPC）運(yùn)行仿真任務(wù)。AIPOD軟件采用了靈活的分布式調(diào)度框架，其軟件本體與其所調(diào)用的各個(gè)設(shè)計(jì)仿真軟件支持在不同的物理機(jī)上執(zhí)行。

根據(jù)客戶需求不同，北鯤云提供了三類HPC集群模式。用戶可以根據(jù)自身特定需求場景、業(yè)務(wù)目標(biāo)等方面綜合考慮，選擇適合的Cloud-HPC集群模式。SaaS模式屬于通用版產(chǎn)品，主要面向有算力需求的客戶，根據(jù)客戶使用的算力大小和時(shí)長進(jìn)行收費(fèi)，從而解決客戶算力不足，作業(yè)長期排隊(duì)等突出問題。產(chǎn)品預(yù)裝了300+的行業(yè)主流應(yīng)用軟件，可實(shí)現(xiàn)開箱即用。

未來的 Agentic HPC，將具備需求預(yù)判、自主優(yōu)化、無需持續(xù)監(jiān)控即可智能響應(yīng)的核心能力。Agentic HPC 平臺(tái)Altair? HPCWorks? 平臺(tái)助力企業(yè)快速捕捉核心價(jià)值，為下一代智能化、自優(yōu)化高性能計(jì)算做好準(zhǔn)備。該平臺(tái)充分利用人工智能輔助功能（包括AI驅(qū)動(dòng)的內(nèi)存資源預(yù)測），精簡作業(yè)提交流程，優(yōu)化集群、云及混合計(jì)算環(huán)境的資源利用率。

未來的 Agentic HPC，將具備需求預(yù)判、自主優(yōu)化、無需持續(xù)監(jiān)控即可智能響應(yīng)的核心能力。Agentic HPC 平臺(tái)Altair? HPCWorks? 平臺(tái)助力企業(yè)快速捕捉核心價(jià)值，為下一代智能化、自優(yōu)化高性能計(jì)算做好準(zhǔn)備。該平臺(tái)充分利用人工智能輔助功能（包括AI驅(qū)動(dòng)的內(nèi)存資源預(yù)測），精簡作業(yè)提交流程，優(yōu)化集群、云及混合計(jì)算環(huán)境的資源利用率。

此外，該平臺(tái)可與 Altair? RapidMiner? 等平臺(tái)集成，允許用戶搭建定制化 AI 模型，此類模型可針對(duì)特定工作負(fù)載進(jìn)行訓(xùn)練。經(jīng)典-量子混合計(jì)算量子計(jì)算領(lǐng)域潛力顯著，有望大幅提升處理速度，推動(dòng)技術(shù)革新邁向全新高度。盡管當(dāng)前量子計(jì)算仍需突破諸多關(guān)鍵挑戰(zhàn)，但已實(shí)現(xiàn)與傳統(tǒng) HPC 的協(xié)同應(yīng)用。

HPC在仿真分析中發(fā)揮著重要的作用，足夠的軟硬件資源可以更好地支持項(xiàng)目開發(fā)。但通常HPC都是搭建在Linux系統(tǒng)下的，需要在linux系統(tǒng)下配置對(duì)應(yīng)的仿真分析軟件，如lsdyna、nastran、ABAQUS、optistruct、star-ccm+等等。提交計(jì)算也是需要開發(fā)Windows用戶界面，或者通過其他客戶端工具如PuTTY等。

HPC在仿真分析中發(fā)揮著重要的作用，足夠的軟硬件資源可以更好地支持項(xiàng)目開發(fā)。但通常HPC都是搭建在Linux系統(tǒng)下的，需要在linux系統(tǒng)下配置對(duì)應(yīng)的仿真分析軟件，如lsdyna、nastran、ABAQUS、optistruct、star-ccm+等等。提交計(jì)算也是需要開發(fā)Windows用戶界面，或者通過其他客戶端工具如PuTTY等。

HS-1在有限的空間內(nèi)進(jìn)行了獨(dú)具匠心的系統(tǒng)設(shè)計(jì)和高密度的模塊化部署，特別適用于需要兼顧計(jì)算性能和部署密度的高密度計(jì)算集群。

2023年8月24日，以“算力互聯(lián)·智領(lǐng)未來”為主題的第十九屆全國高性能計(jì)算學(xué)術(shù)年會(huì)（CCF HPC China 2023）在青島·紅島國際會(huì)議展覽中心拉開帷幕。

用戶可以通過用戶門戶配置自己獨(dú)特的VDI或HPC集群，這些集群可根據(jù)用戶自己的仿真需求進(jìn)行定制。用戶可從AWS云部署模板提供的豐富選項(xiàng)中進(jìn)行選擇，其中包含CPU、內(nèi)存、存儲(chǔ)和網(wǎng)絡(luò)容量的各種組合。由AWS亞馬遜云提供支持的Ansys Gateway還為每個(gè)求解器提供推薦的模板類型。云定制化功能使Ansys Fluent用戶能夠在求解速度和計(jì)算成本之間進(jìn)行平衡，以滿足他們自己的特定需求。

同時(shí)云計(jì)算平臺(tái)能夠大幅度地降低投入成本，不需要客戶花費(fèi)大量的人力物力從 0 開始搭建。北鯤云為HPC應(yīng)用加速北鯤云為工程機(jī)械、航空航天、汽車工業(yè)、新能源電池等領(lǐng)域的用戶提供專業(yè)的Cloud-HPC解決方案。目前已成功服務(wù)多家企業(yè)、科研所及高校。

同時(shí)云計(jì)算平臺(tái)能夠大幅度地降低投入成本，不需要客戶花費(fèi)大量的人力物力從 0 開始搭建。北鯤云為HPC應(yīng)用加速北鯤云為工程機(jī)械、航空航天、汽車工業(yè)、新能源電池等領(lǐng)域的用戶提供專業(yè)的Cloud-HPC解決方案。目前已成功服務(wù)多家企業(yè)、科研所及高校。

整體排名表明，北鯤云的BurstFS在云上存儲(chǔ)領(lǐng)域獨(dú)占鰲頭，甚至可以與大部分本地超級(jí)計(jì)算機(jī)集群相媲美。 BurstFS作為一個(gè)Built for the Cloud的高性能并行文件系統(tǒng)，可為任何公有云上支持RoCE/InfiniBand/Ethernet的使用GPU或CPU的HPC集群提供最高帶寬和最低延遲性能，并且能同云廠商的對(duì)象存儲(chǔ)做自動(dòng)化整合。

核心網(wǎng)絡(luò)通過PFC/RoCE等技術(shù)的支撐，使得高性能計(jì)算網(wǎng)絡(luò)具備更高的開放性，在沒有降低計(jì)算效率的前提下，降低了整個(gè)高性能集群平臺(tái)建設(shè)的成本。文章來源：架構(gòu)師技術(shù)聯(lián)盟

Slurm（Simple Linux Utilities for Resource Management）是一款集群資源管理及作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)，適用于Linux集群環(huán)境。目前Slurm作為一款免費(fèi)且開源的軟件，被全世界很多超算中心，研發(fā)企業(yè)、實(shí)驗(yàn)室及大學(xué)部署并使用。在 TOP500 排名前 10 的HPC系統(tǒng)中，有超過半數(shù)是使用Slurm來執(zhí)行工作負(fù)載管理工作。

使用我們集成的云自動(dòng)化引擎快速上下擴(kuò)展，可節(jié)省團(tuán)隊(duì)的時(shí)間及預(yù)算，并可獲得對(duì)企業(yè)的 HPC 和云操作的統(tǒng)一、集中的視圖，甚至可用于多云和多集群安裝。全新 AI 集成和精簡報(bào)告讓 HPC 和 AI 相輔相成、互為倚仗，為工作負(fù)載提供動(dòng)力。Altair HPCWorks 平臺(tái)全新集成了 AI 功能，不僅簡化了作業(yè)提交流程，還縮短了等待時(shí)間。

“神工坊“高性能仿真平臺(tái)是基于國家超級(jí)計(jì)算無錫中心HPC集群打造的圖形化仿真平臺(tái)，為用戶提供“PC式”高性仿真體驗(yàn)。HPC集群采用專用服務(wù)器，并行文件系統(tǒng)，InfiniBand網(wǎng)絡(luò)等高性能仿真硬件，可以大幅提升仿真求解的效率。

高性能計(jì)算機(jī) (HPC) 通過模擬、建模和分析，可以輕松解決這類以及更多其他科學(xué)難題。高性能計(jì)算系統(tǒng)幫助人們解決世界上最棘手的難題，引領(lǐng)人類走向“第四次工業(yè)革命”。

如果選擇采購可以滿足最大峰值的集群,那么在業(yè)務(wù)量不能時(shí)刻保持高峰時(shí),就會(huì)存在很大的成本浪費(fèi)。而一旦服務(wù)器不足,則無法滿足業(yè)務(wù)高峰時(shí)的測序任務(wù)。在各個(gè)測序分析的階段需要借助不同規(guī)格的計(jì)算資源,線下計(jì)算集群往往無法適應(yīng)快速的擴(kuò)縮容。